MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 44995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020833	CTG	2	6	242036	242041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4002	NC_020833	CGT	2	6	242230	242235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4003	NC_020833	TGA	2	6	242300	242305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332750
4004	NC_020833	CAC	2	6	242306	242311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332750
4005	NC_020833	GGT	2	6	242320	242325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4006	NC_020833	AAG	2	6	242333	242338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332750
4007	NC_020833	GTG	2	6	242365	242370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4008	NC_020833	AGA	2	6	242373	242378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332750
4009	NC_020833	TTA	2	6	242425	242430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332750
4010	NC_020833	TGG	2	6	242450	242455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4011	NC_020833	GTA	2	6	242491	242496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332750
4012	NC_020833	GT	4	8	242516	242523	0 %	50 %	50 %	0 %	472332750
4013	NC_020833	CGGT	2	8	242579	242586	0 %	25 %	50 %	25 %	472332750
4014	NC_020833	GGT	2	6	242650	242655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4015	NC_020833	GCA	2	6	242668	242673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4016	NC_020833	ATTAA	2	10	242710	242719	60 %	40 %	0 %	0 %	472332750
4017	NC_020833	CAA	2	6	242739	242744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332750
4018	NC_020833	GGTGC	2	10	242836	242845	0 %	20 %	60 %	20 %	472332750
4019	NC_020833	ACG	2	6	242855	242860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4020	NC_020833	CA	3	6	242905	242910	50 %	0 %	0 %	50 %	472332750
4021	NC_020833	ATC	2	6	243006	243011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332750
4022	NC_020833	GTG	2	6	243016	243021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4023	NC_020833	GCA	2	6	243124	243129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4024	NC_020833	CTT	2	6	243135	243140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332750
4025	NC_020833	GGT	2	6	243244	243249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4026	NC_020833	CGC	2	6	243355	243360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332750
4027	NC_020833	CGG	2	6	243374	243379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332750
4028	NC_020833	GAT	2	6	243399	243404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332750
4029	NC_020833	GTG	2	6	243452	243457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332750
4030	NC_020833	CTTACG	2	12	243495	243506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472332750
4031	NC_020833	AAG	2	6	243548	243553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332750
4032	NC_020833	AAGTGG	2	12	243671	243682	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	472332750
4033	NC_020833	GAA	2	6	243715	243720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332750
4034	NC_020833	ACC	2	6	243929	243934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332750
4035	NC_020833	A	6	6	243946	243951	100 %	0 %	0 %	0 %	472332750
4036	NC_020833	ATTC	2	8	244016	244023	25 %	50 %	0 %	25 %	472332750
4037	NC_020833	TGAATT	2	12	244047	244058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472332750
4038	NC_020833	AGC	2	6	244086	244091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332750
4039	NC_020833	GTT	2	6	244092	244097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332750
4040	NC_020833	TAT	2	6	244510	244515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332751
4041	NC_020833	AT	3	6	244518	244523	50 %	50 %	0 %	0 %	472332751
4042	NC_020833	TTAC	2	8	244543	244550	25 %	50 %	0 %	25 %	472332751
4043	NC_020833	CAA	2	6	244574	244579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332751
4044	NC_020833	AATTA	2	10	244582	244591	60 %	40 %	0 %	0 %	472332751
4045	NC_020833	GTA	2	6	244610	244615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332751
4046	NC_020833	TCTTA	2	10	244635	244644	20 %	60 %	0 %	20 %	472332751
4047	NC_020833	TAAAA	2	10	244660	244669	80 %	20 %	0 %	0 %	472332751
4048	NC_020833	A	6	6	244666	244671	100 %	0 %	0 %	0 %	472332751
4049	NC_020833	TAA	2	6	244701	244706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332751
4050	NC_020833	A	6	6	244705	244710	100 %	0 %	0 %	0 %	472332751
4051	NC_020833	TTA	2	6	244756	244761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332751
4052	NC_020833	TTA	2	6	244769	244774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332751
4053	NC_020833	GAT	2	6	244820	244825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332751
4054	NC_020833	TAAA	2	8	244848	244855	75 %	25 %	0 %	0 %	472332751
4055	NC_020833	AT	3	6	244929	244934	50 %	50 %	0 %	0 %	472332751
4056	NC_020833	GTG	2	6	244978	244983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332751
4057	NC_020833	CAT	2	6	245018	245023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332751
4058	NC_020833	TAGA	2	8	245058	245065	50 %	25 %	25 %	0 %	472332751
4059	NC_020833	GAA	2	6	245119	245124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332751
4060	NC_020833	T	7	7	245200	245206	0 %	100 %	0 %	0 %	472332751
4061	NC_020833	TAA	2	6	245209	245214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332751
4062	NC_020833	GTTA	2	8	245290	245297	25 %	50 %	25 %	0 %	472332751
4063	NC_020833	TGA	2	6	245341	245346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332751
4064	NC_020833	GAA	2	6	245375	245380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332751
4065	NC_020833	ATAA	2	8	245432	245439	75 %	25 %	0 %	0 %	472332751
4066	NC_020833	GTT	2	6	245453	245458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332751
4067	NC_020833	A	8	8	245482	245489	100 %	0 %	0 %	0 %	472332751
4068	NC_020833	TAAT	2	8	245490	245497	50 %	50 %	0 %	0 %	472332751
4069	NC_020833	AAG	2	6	245501	245506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332751
4070	NC_020833	ATA	2	6	245532	245537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332751
4071	NC_020833	TATTAG	2	12	245542	245553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472332751
4072	NC_020833	ATC	2	6	245554	245559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332751
4073	NC_020833	ATA	2	6	245628	245633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332751
4074	NC_020833	ATAAGA	2	12	245636	245647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472332751
4075	NC_020833	AAAG	2	8	245676	245683	75 %	0 %	25 %	0 %	472332751
4076	NC_020833	AG	3	6	245736	245741	50 %	0 %	50 %	0 %	472332751
4077	NC_020833	AAAG	2	8	245803	245810	75 %	0 %	25 %	0 %	472332751
4078	NC_020833	AT	3	6	245813	245818	50 %	50 %	0 %	0 %	472332751
4079	NC_020833	TTC	2	6	246071	246076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332752
4080	NC_020833	TCA	2	6	246128	246133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332752
4081	NC_020833	GAA	2	6	246208	246213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332752
4082	NC_020833	GGC	2	6	246226	246231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332752
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4084	NC_020833	GTT	2	6	246256	246261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332752
4085	NC_020833	GAA	2	6	246280	246285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332752
4086	NC_020833	CCG	2	6	246299	246304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332752
4087	NC_020833	T	6	6	246375	246380	0 %	100 %	0 %	0 %	472332752
4088	NC_020833	T	6	6	246517	246522	0 %	100 %	0 %	0 %	472332752
4089	NC_020833	ACC	2	6	246523	246528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332752
4090	NC_020833	CCG	3	9	246548	246556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332752
4091	NC_020833	TCA	2	6	246644	246649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332752
4092	NC_020833	ATA	2	6	246650	246655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332752
4093	NC_020833	TG	3	6	246671	246676	0 %	50 %	50 %	0 %	472332752
4094	NC_020833	CTT	2	6	246705	246710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332752
4095	NC_020833	CAA	2	6	246747	246752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332752
4096	NC_020833	TGC	2	6	246787	246792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
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4098	NC_020833	TGA	2	6	246948	246953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332752
4099	NC_020833	TTG	2	6	246999	247004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332752
4100	NC_020833	GCT	2	6	247015	247020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
4101	NC_020833	CTG	2	6	247083	247088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
4102	NC_020833	AAT	2	6	247141	247146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332752
4103	NC_020833	GGT	2	6	247152	247157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332752
4104	NC_020833	AT	3	6	247199	247204	50 %	50 %	0 %	0 %	472332752
4105	NC_020833	GCC	2	6	247264	247269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332752
4106	NC_020833	GCAC	2	8	247283	247290	25 %	0 %	25 %	50 %	472332752
4107	NC_020833	GTT	2	6	247338	247343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332752
4108	NC_020833	T	6	6	247509	247514	0 %	100 %	0 %	0 %	472332753
4109	NC_020833	TATT	2	8	247520	247527	25 %	75 %	0 %	0 %	472332753
4110	NC_020833	T	6	6	247533	247538	0 %	100 %	0 %	0 %	472332753
4111	NC_020833	TTGGT	2	10	247574	247583	0 %	60 %	40 %	0 %	472332753
4112	NC_020833	GGT	2	6	247633	247638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332753
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4122	NC_020833	CTG	2	6	248170	248175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332753
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4491	NC_020833	AAT	2	6	274737	274742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332773
4492	NC_020833	GTA	2	6	274757	274762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332773
4493	NC_020833	AAT	2	6	274791	274796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332773
4494	NC_020833	ACC	2	6	274885	274890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332773
4495	NC_020833	CTTTGG	2	12	274946	274957	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	472332773
4496	NC_020833	ATCA	2	8	275112	275119	50 %	25 %	0 %	25 %	472332773
4497	NC_020833	CCA	2	6	275220	275225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332773
4498	NC_020833	GT	3	6	275269	275274	0 %	50 %	50 %	0 %	472332773
4499	NC_020833	CTTT	2	8	275284	275291	0 %	75 %	0 %	25 %	472332773
4500	NC_020833	T	6	6	275289	275294	0 %	100 %	0 %	0 %	472332773

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